Martín Wagner nació el 19 de septiembre de 1985 en San José, partido de Coronel Suárez, Provincia de Buenos Aires, en el seno de una familia descendiente de alemanes del Volga.
Se inició en el Club Independiente de su pueblo natal y jugó en las inferiores del Club Olimpo de Bahía Blanca. En 2006 fue campeón en ese mismo club, ascendiendo a la Primera "A".





